Zbiory muzeum liczą ponad 3000 eksponatów. Muzeum prezentuje głównie dorobek tzw. Paszyńskiego Ośrodka Twórczości Ludowej.


Zbiory tworzą dary artystów odwiedzających Paszyn, obiekty zakupione przez księży oraz stanowiące przykład ich osobistej pasji zbierackiej. Prócz tego na ekspozycji prezentowane są m.in.: obrazy Marii Wnęk, Katarzyny Gawłowej, czy rzeźby Stanisława Hołdy i innych wybitnych polskich twórców współczesnych.

Muzeum nie posiada wyodrębnionych działów. Uwagę zwracają współczesne prace rzeźbiarskie (około 1400 sztuk), które uszeregowano wedle klucza autorskiego lub tematycznego. Drugą ważną grupę stanowi około 1600 obrazów na szkle. Margines zbioru tworzą przykłady dawnej rzeźby z terenu Nowosądecczyzny i Tarnowskiego, dary z kraju i różnych stron świata ofiarowywane przez zwiedzających i przyjaciół muzeum (np. malarstwo z Meksyku) oraz pojedyncze eksponaty etnograficzne, jak słynne paszyńskie palmy wielkanocne i wieńce dożynkowe.


Rzeźby paszynian, mimo pochodzenia z jednego ośrodka, są bardzo zróżnicowane. Obok prostych, drewnianych, kolorowanych kredkami prac Wojciecha Oleksego, warto zwrócić uwagę na dostojne kamienne figury Zdzisława Orleckiego, ascetyczne postacie Stanisława Miki, czy barwne, optymistyczne kompozycje Mieczysława Piwki. Można w nich dojrzeć wpływ dawnej rzeźby ludowej, znanej mieszkańcom Paszyna z przydrożnych i przydomowych kapliczek.